Logga in

Registrera

1MB335 · Uppsala universitet

Genomik och bioinformatik

5 tentor

Kom igång gratis

Kursinnehåll
2025-03-17
0 uppgifter
2024-03-15
0 uppgifter
2023-03-16
0 uppgifter
2022-03-17
0 uppgifter
2021-03-22
0 uppgifter

Vad ingår?

0 uppgifter

Sorterat efter ämne och svårighet, direkt från tentor.

5 tentor med lösningar

Alla tidigare tentor samlade, öva på riktiga examensfrågor.

AI-handledare (KAI)

Få steg-för-steg-hjälp dygnet runt, skräddarsydd för den här kursen.

0 studieplaner

Personliga studieplaner som anpassar sig till dina framsteg.

Generera tester

Skapa anpassade övningstester baserat på ämne och svårighet.

Framstegsanalys

Se vad du vet, vad du behöver granska och vad som finns kvar.

Kurs info

KurssidaKursplan
HP
10
Språk
Svenska
Nivå
Grundnivå
Fakultet
Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden
Institution
Institutionen för biologisk grundutbildning

Lärandemål

Efter godkänd kurs ska studenten kunna:

  • beskriva genomets funktion hos människan och modellorganismer
  • förklara principerna för sekvensinpassning, igenkänning av mönster i sekvenser samt fylogenianalys
  • redogöra för metoder för att studera genom, såsom microarray-analyser, associationsstudier (GWAS), sekvensering av genom och transkriptom, och utvärdera kvaliteten på data från sådana studier
  • beskriva metoder för att modifiera genom (t.ex. med CRISPR) samt översiktligt beskriva metoder att studera proteom och metabolom
  • konstruera bioinformatiska arbetsflöden och använda skript för datahantering
  • konstruera strategier för att bioinformatiskt och/eller experimentellt angripa givna biologiska och biomedicinska frågeställningar med av kursen behandlad metodik och sammanställa, analysera och utvärdera resultat från sådana experiment
  • beskriva och utvärdera de forskningsmässiga, kommersiella och etiska konsekvenserna för samhället av utvecklingen inom genomik och bioinformatik.
Kursinnehåll
Kursen innehåller teori kring genomstruktur med fokus på det mänskliga genomet. Hur genom, transkriptom, proteom, och metabolom förhåller sig till och reglerar varandra. Genomvariation och dess betydelse för fenotypisk variation och sjukdomar. Moderna storskaliga metoder för analyser av dessa områden presenteras, inklusive hur storskaliga plattformar fungerar logistiskt och hur processer kvalitetssäkras. Bland de teknologier som behandlas ingår bl.a. sekvens- och hybridiseringsteknologi för genom- och transkriptomanalys samt proteom- och metabolomanalys. Kursen behandlar även bioinformatik med inriktning på sekvensdata inklusive publika bioinformatiska databaser, deras utformning och sökverktyg, identifiering av kodande sekvenser, parvis och multipel sekvensinpassning, heuristiska metoder för sekvensinpassning (t.ex. BLAST), metoder för igenkänning av mönster i sekvenser (t.ex. identifiering av promotorer), metoder för fylogenianalys, automatisering av bioinformatiska analyser med hjälp av skriptprogrammering. Vidare behandlas strategier för att med hjälp av experimentella teknologier t.ex. finna och undersöka betydelsen av genomets variation för sjukdomstillstånd, samt strategier för att bioinformatisk lösa givna biologiska problem genom att identifiera och använda lämpliga publika databaser i kombination med existerande programvara. Kursen tar även upp för samhället forskningsmässiga, kommersiella och etiska konsekvenser av utvecklingen inom bioinformatik, genomik, funktionsgenomik och systembiologi.
Förutsättningar
  • 60 hp inom civilingenjörsprogrammet i molekylär bioteknik inklusive Grundläggande organisk kemi eller Organisk kemi I och Sannolikhet och statistik. Genomgången Bioinformatisk strukturbiologi varav 2 hp ska vara avklarade, samt genomgångna Databasteknik I och Programmeringsteknik II.
Litteratur

Saknas

Redo att boosta dina studier?

Gör som 15 000+ studenter och ta kontroll över ditt tentaplugg.

Kom igång gratis

Produkt

  • Priser

  • Karriär

Företag

  • Om oss

  • Blogg

  • Användarvillkor

  • Integritet

  • Support

Universitet

  • KTH

  • Uppsala universitet

  • Linköpings universitet

  • Chalmers

  • Lunds universitet

  • Luleå tekniska universitet

  • Stockholms universitet

  • Gymnasiet

Socialt

  • Instagram

  • Facebook

  • YouTube

  • TikTok

  • Linkedin

© 2026 Crash Course Sverige AB