förklara och värdera olika fylogenetiska optimalitetskriterier samt välja lämpligt kriterium för att lösa ett givet problem
planera, utföra och utvärdera en fylogenianalys samt förklara de olika delmomenten.
Kursinnehåll
Fylogenetiska träd och andra modeller för evolutionära släktskap. Optimalitetskriterier för val av hypotes. Substitutionsmodeller för DNA och andra datatyper. Superträd, konsensusträd, kompatibilitet mellan träd. Algoritmer för evaluering av trädrummet; Markov Chain Monte Carlo, genetiska algoritmer. Evaluering av resultat från fylogenianalyser, datering av fylogenier.
Förutsättningar
120 hp samt Molekylär evolution. Engelska 6. (Med en svensk kandidatexamen uppfylls kravet på engelska.)