1MB517 · Uppsala universitet
Populationsgenomisk analys
Ny kurs
Inga tentor än
Ladda upp dina tidigare tentor och få hjälp med att strukturera ditt studiematerial
Få dina tentauppgifter kategoriseradeBli guidad genom ditt studiematerialFå hjälp direkt med teori och tipsHåll koll på dina framsteg
HP
10
Språk
Engelska
Nivå
Avancerad nivå
Fakultet
Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden
Institution
Institutionen för biologisk grundutbildning
Lärandemål
- Kursen syftar till att ge kunskap om teori och analysmetoder inom populationsgenomiken.
- förklara populationsgenetiska/genomiska principer och lösa biologiska problem med hjälp av dessa.
- analysera genomsekvensdata från ett stort antal individer, med avseende på t.ex. mappning av egenskap och identifiering av signaler från selektion.
- använda simuleringar för att testa så väl som generera hypoteser, och jämföra med empiriska observationer.
- identifiera relevanta populationsgenetiska problemställningar och formulera strategier för att lösa problemen.
- kritiskt analysera, värdera och sammanställa erhållna resultat från populationsgenomiska analyser.
Kursinnehåll
Kursen behandlar populationsgenetikens principer; inklusive nedärvning, mendelsk genetik, allelfrekvenser, allelfrekvensspektrum, kopplingsojämvikt, genetisk diversitet och mått på diversitet, Wright-Fisher-modellen, koalescensteori, inavel, populationsstruktur, selektion, och kvantitativ genetik. Dessa principer kopplas till empiriska genom-variations data och till simuleringsverktyg. Praktiska moment som behandlas inkluderar skattning av parametrar (t.ex. mutationstakt och rekombinationstakt), mappning av egenskaper (såväl kvantitativa som diskreta), test av modeller, inklusive neutralitetstest och selektionstest.
Förutsättningar
- Avklarade kurser om 120 hp samt minst 5 hp av kursen Genomanalys. Engelska 6. (Med en svensk kandidatexamen uppfylls kravet på engelska.)
Liknande kurser vid andra universitet
Gör som 15 000+ studenter och ta kontroll över ditt tentaplugg.
Kom igång gratis