Syftet med kursen är att tillämpa tidigare förvärvade kunskaper i ett bioinformatiskt projekt.
planera och genomföra ett bioinformatiskt projekt som syftar till att lösa ett biologiskt, biomedicinskt eller tekniskt problem
kritiskt analysera, värdera och sammanställa erhållna resultat och presentera dessa i skriftlig och muntlig form för olika målgrupper
göra välmotiverade vetenskapliga, samhälleliga och etiska bedömningar av projektets alla delar
söka, värdera och använda vetenskaplig litteratur i ämnen som ligger inom ramen för kursen och implementera denna kunskap i projektet.
Kursinnehåll
Studierna genomförs i form av projektarbeten. Projekten utformas i samråd med uppdragsgivare inom industrin eller akademin och omfattar utveckling av nya verktyg eller tillämpningar av redan befintliga verktyg för att lösa biologiska och biomedicinska problem. Projekten kan t.ex. innefatta genomannotering, genexpressionsanalys, populationsgenetiska analyser eller modellering av metabola reaktionsvägar. Det ingår även träning i att kritiskt analysera och redogöra för styrkor och svagheter i sina egna och andras muntliga och skriftliga presentationer samt i projektarbetet (ingenjörsmässighet, vetenskapligt förhållningssätt och experimentell förmåga).
Förutsättningar
Alt 1. 210 hp inom Civilingenjörsprogrammet i molekylär bioteknik inklusive 25 hp från avslutade profilkurser: Proteomik och metabolomik, Informationsutvinning I, Statistisk slutledning för bioinformatik eller Statistisk slutledning för tekniska tillämpningar, Molekylär evolution, Informationshanteringssystem, Big data i biovetenskap, Genomanalys, Kunskapsbaserade system inom bioinformatik, Automatiserad prediktiv modellering. Alt 2. 30 hp inom Masterprogrammet i bioinformatik inklusive 25 hp av följande kurser: Skriptprogrammering eller Programmering i Python eller Programmeringsteknik I, Statistisk slutledning för bioinformatik eller Statistisk slutledning för tekniska tillämpningar, Molekylär evolution, Informationshanteringssystem, Big data i biovetenskap, Genomanalys, Kunskapsbaserade system inom bioinformatik. Engelska 6. (Med en svensk kandidatexamen uppfylls kravet på engelska.)