3FB034 · Uppsala universitet
Big data i biovetenskap
Ny kurs
Inga tentor än
Ladda upp dina tidigare tentor och få hjälp med att strukturera ditt studiematerial
Få dina tentauppgifter kategoriseradeBli guidad genom ditt studiematerialFå hjälp direkt med teori och tipsHåll koll på dina framsteg
HP
5
Språk
Svenska
Nivå
Avancerad nivå
Fakultet
Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden
Institution
Institutionen för farmaceutisk biovetenskap
Lärandemål
Efter godkänd kurs ska studenten kunna
- förklara teorier och metoder relevanta för hantering och analys av stora datamängder inom biovetenskapliga tillämpningar
- använda moderna system för hantering och analys av stora datamängder inom biovetenskapliga tillämpningar;
- analysera egenskaper hos dataintensiva biovetenskapliga tillämpningar och använda analysen till att föreslå lämpliga strategier för att hantera tillämpningen;
- kritiskt analysera, diskutera och presentera lösningar skriftligt och muntligt.
Kursinnehåll
Metodik vid biovetenskapliga tillämpningar där begrepp och metoder inom storskalig datahantering används. Processning av biovetenskapliga data med programmeringsmodellen MapReduce, exempelvis Apache Spark, batchsystem på beräkningskluster, reproducerbar dataanalys med hjälp av workflowsystem, analys med mjukvarucontainers och mikrotjänstbaserade ramverk exempelvis Kubernetes. Användning av storskaliga lagringssystem och virtualiserade miljöer. Biovetenskapliga problemställningar med storskaliga data inom exempelvis genomik, proteomik, metabolomik, cellbiologi, läkemedelsutveckling och AI/maskininlärning.
Förutsättningar
- 120 hp inklusive (1) 15 hp datavetenskap, varav 5 hp programmering, och 15 biologi; eller (2) 15 hp inom Masterprogram i bioinformatik, varav 5 hp programmering; eller (3) 15 hp inom Masterprogram i biofysik, varav 5 hp programmering. Engelska 6. (Med en svensk kandidatexamen uppfylls kravet på engelska.)
Litteratur
Saknas
Liknande kurser vid andra universitet
Gör som 15 000+ studenter och ta kontroll över ditt tentaplugg.
Kom igång gratis