Tillämpad farmaceutisk strukturbioinformatik

Lärandemål

Efter fullgjord kurs skall studenten:

• Kunna redogöra för bioinformatiska verktyg såsom MODELER, PROCHECK och GROMACS, samt hur biologiska och kemiska databaser kan användas för att lösa problem inom läkemedelsområdet och biovetenskaperna.
• Kunna arbeta med sekvensdatabaser och använda verktyg för sekvensinpassning.
• Kunna arbeta med databaser såsom Pfam och PROSITE, använda tekniker och verktyg för sekvensmotivsökning samt förutsäga om proteiners funktion och bindningsställen för läkemedel.
• Kunna bygga ett proteins 3D-struktur genom homologimodellering i en dator.
• Kunna utföra molekyldynamiska simuleringar av proteiner genom datorberäkningar samt kunna analysera resultaten från sådana beräkningar.
• Kunna utföra molekylär dockning av läkemedel samt kunna använda detta vid läkemedelsscreening.
• På ett övergripande sätt kunna redogöra för teorier, principer och metoder som används under ovan uppräknade punkter.