beskriva olika typer av protein-ligand-interaktioner samt karakterisera bindningsfickor
använda sökmetoder för att hitta föreningar med specifika egenskaper i substansdatabaser
sätta upp, utföra och utvärdera virtuell sållning av stora dataset med hjälp av olika metoder
redogöra för och använda metoder för molekyldynamiksimuleringar och fria energiberäkningar
redogöra för och använda kvantkemiska metoder vid utveckling av läkemedelsmolekyler
Kursinnehåll
Kursen inbegriper en fördjupning i metoder och strategier som används i läkemedelskemisk forskning med inriktning på datorbaserad läkemedelsdesign. Kursen behandlar begrepp och metoder såsom protein-ligand-interaktioner, dockning, kemoinformatik, likhetssökning, molekyldynamiksimuleringar, fria energiberäkningar, samt kvantkemi. Applikationer av dessa tekniker inom virtuell screening, strukturbaserad design samt ligandbaserad design kommer att belysas och praktiskt användas i datorövningar under kursen.
Förutsättningar
150 hp varav 120 hp inom biomedicin, farmaceutisk vetenskap, naturvetenskap och/eller teknik. Tidigare studier ska innehålla 10 hp allmän och organisk kemi. Genomgången kurs Läkemedelskemi med datorbaserad läkemedelsdesign. Dessutom krävs kunskaper i engelska motsvarande Engelska 6. (Med en svensk kandidatexamen uppfylls kravet på engelska.)