Introduktion till bioinformatik

Lärandemål

• Förklara hur bioinformatik och storskalig molekylärbiologisk data kan användas för att lösa biologiska problem.
• Förklara fördelarna och nackdelarna med de olika metoderna för storskalig DNA- and protein-sekvensering samt deras tillämpningar inom genomiken.
• Beskriva och tillämpa metoder för analys av sekvensdata.
• Beskriva metoder för att anpassa sekvenser med syfta att identifiera mutationer och att uppskatta mängden mRNA, proteiner och gener.
• Beskriva och tillämpa algoritmer för att utforska och visualisera hög-dimensionell data.
• Beskriva och tillämpa metoder för att identifiera biologiska effekter i data från storskalig DNA-sekvensering.
• Beskriva och tillämpa metoder för att utvärdera statistisk signifikans i hög-dimensionell data.
• Förklara och kritiskt diskutera i) kvantitativitet, ii) "the curse of dimensionality" samt iii) korrelation och kausalitet i relation till storskalig molekylärbiologisk data.