TDA507 · Chalmers tekniska högskola
Beräkningsmetoder inom bioinformatik
Ny kurs
Inga tentor än
Ladda upp dina tidigare tentor och få hjälp med att strukturera ditt studiematerial
Få dina tentauppgifter kategoriseradeBli guidad genom ditt studiematerialFå hjälp direkt med teori och tipsHåll koll på dina framsteg
HP
Språk
Engelska
Institution
Data- och informationsteknik
Lärandemål
- Kunskap och förståelse
- beskriva och sammanfatta problem som har tagits upp i bioinformatiklitteraturen,och beräkningsmetoder för att lösa dem
- F
- ä
- r
- d
- i
- g
- h
- e
- t
- o
- c
- f
- ö
- m
- å
- a
- utforma och implementera beräkningsproblemlösningar inom bioinformatik
- Värderingsförmåga och förhållningssätt
- kritiskt diskutera olika bioinformatikmetoder som adresserar samma uppgift eller relaterade uppgifter och diskutera skillnader i de uppdragen uppgifterna ellerskillnader i beräkningsmetodernaidentifiera situationer där samma beräkningsmetoder tillämpas när man tar itu med olika problem, även inom olika tillämpningsområden
Kursinnehåll
Beräkningsmetoder och begrepp som presenteras i kursen är: dynamisk programmering, heuristiska algoritmer, grafpartitionering, image skeletonisation, utjämning och kantdetektering, klustring, undermatrismatchning, geometrisk hashning, constraint logic programming, Monte Carlo-optimering, simulated annealing, självundvikande vandring. Bland de problem som hämtats från biologin är: sekvensinpass, domäntilldelning, jämförelse av strukturer, jämförande modellering, proteinveckning, fold recognition, upptäcka kanaler, molekyldockning, proteindesign.
Förutsättningar
- Grundläggande behörighet för avancerad nivå
Litteratur
Föreläsningsmaterial; webbaserade resurser, utvalda vetenskapliga artiklar.
Liknande kurser vid andra universitet
Gör som 15 000+ studenter och ta kontroll över ditt tentaplugg.
Kom igång gratis