beskriva och värdera metoder och strategier för transkriptom- och proteomanalys
identifiera proteiner med hjälp av masspektra och genomdatabaser
på engelska sammanfatta innehållet och tolka budskapet i originallitteratur inom kursens område
Kursinnehåll
Kvantitativ mRNA-analys med hjälp av DNA-mikroarrayer, qPCR och metoder baserade på Next Generation Sequencing. En- och flerdimensionella gel- och kromatografibaserade separationsmetoder för proteiner och peptider. Identifiering av proteininnehåll i celler m h a enzymatisk klyvning, MS- och MS/MS-analys samt sökning i genomdatabaser. Inmärkningsbaserad respektive inmärkningsfri proteinkvantifiering baserad på MS och MS/MS. Analys av posttranslationella modifieringar. Analys av protein-proteininteraktioner med bl a Y2H-metodik, affinitetskromatografi och proteinmikroarrayer. Användning av immunoassays i proteomiktillämpningar. Karakterisering av sjukdomsberoende proteomförändringar för biomarkörbaserad diagnostik inklusive några grundläggande principer för dataanalys. Analys av enskilda celler. Human Proteome Atlas.
Förutsättningar
Främst biokemi och proteinkemi. Det är dessutom en fördel att vara orienterad inom genteknik, analytisk kemi, cellbiologi och bioinformatik.
Litteratur
Principles of proteomics. - Twyman, Richard M.
Redo att boosta dina studier?
Gör som 15 000+ studenter och ta kontroll över ditt tentaplugg.