Kursen ger en fördjupad förståelse för sambandet struktur – funktion - dynamik hos biologiska molekyler. Efter väl inhämtad kurs kan den studerande:
Kunna beskriva och förklara begrepp, metoder och teorier för bestämning av biomolekylers struktur och dynamik• Med kunskap om strukturbiologiska tekniker kunna föreslå val av metod för lösning av ett givet strukturanalytiskt problem• Tolka data från strukturbiologiska experiment och med hjälp av molekylär grafik illustrera och förklara struktur-funktionssamband
Kursinnehåll
Kursen ger en introduktion till en rad tekniker som används för att bestämma och/eller analysera strukturer av biomolekyler, så som proteiner, nukleinsyror och deras komplex. NMR spektroskopi: teori och applikationer på biomolekyler, förfarande vid strukturbestämning och dynamisk analys av proteiner. Röntgenkristallografi: proteinkristallisering, röntgendiffraktionsteori och förfarande vid strukturbestämning. En översiktlig introduktion ges till ytterligare komplementära strukturanalysmetoder, såsom t ex SAXS + EM för att bättre belysa styrkor och svagheter hos de olika teknikerna. Som ett verktyg behandlas dessutom molekylär grafik och dess användning för strukturanalys och illustration.
Förutsättningar
Organisk kemi och biokemi inklusive grundläggande kunskaper om aminosyror och strukturelement i proteiner.
Litteratur
NMR Spectroscopy – Principles and Applications to Proteins. - P. Lundström
Crystallography made crystal clear: a guide for users of macromolecular models - Rhodes, Gale., Rhodes, Gale.
Laborationskompendier från avdelningen. - Laborationskompendier från avdelningen.
Reviews och Vetenskapliga artiklar inom ämnet. - Reviews och Vetenskapliga artiklar inom ämnet.